医学科学三处
医学科学三处主要资助神经系统和精神疾病以及影像医学与生物医学工程领域的基础研究。
神经和精神系统（H09）：主要资助神经系统各类非肿瘤性疾病的病因、发病机理、诊断、治疗的基础研究和应用基础研究。本科学处不仅关注神经系统常见病，如脑血管病、癫痫、神经退行性疾病、脑与脊髓的损伤与修复的研究，同时也重视对罕见的神经系统疾病的研究。疼痛尤其是慢性痛的机理研究，寻求有效的镇痛方法也是资助的重点之一。
现代疾病谱的一个重要特征是心理障碍和精神疾病的发生率迅速上升，研究精神疾病的核心问题是发现与疾病相关的生物学基础，阐明病因机制，以期实现疾病的早期发现、客观诊断和对因治疗。2010年度申请的项目中，关注精神分裂症、抑郁症的多，关注孤独症、注意缺陷综合征的少，尤其是有关危机干预的更少。今后，应加强研究遗传与环境因素的相互作用在心理障碍和精神疾病发生发展中的规律，发现潜在的病因，建立可监测心理障碍和精神疾病发生、发展及预后的在体生物学标记，优化心理、行为学检查技术，实现心理障碍和精神疾病的早期发现和诊断；通过药物或非药物手段对心理障碍和精神疾病实行早期干预和治疗，从而降低我国人群的心理障碍和精神疾病的发病率。
近年来，神经病学领域获资助项目选题趋同化比较明显，脑卒中、癫痫、神经退行性疾病等领域的项目比较集中。2010年度神经免疫性疾病领域获资助的项目明显增加，今后还会继续给予关注，并加强对神经系统感染性疾病和艾滋病脑病相关研究的资助。脑血管病的研究虽然申请项目很多，但有特色的少，尤其是关于脑出血的研究能够获得资助的更少。疼痛研究还需要加强基础与临床的结合，开展疼痛机理的研究。术后认知功能障碍是麻醉科医生关注的热点，但我国相关研究基础较弱，需要扩大国际交流，开拓视野。本科学处希望进一步均衡资助来自神经内科、神经外科、精神科及相关学科如儿科、麻醉科等学科申请人的申请。鼓励临床医生与从事神经科学基础研究的学者联合开展实质性的研究。
影像医学/生物医学工程（H18）：影像医学与生物医学工程领域是以医学与数学、物理学、化学、信息科学、工程与材料、生命科学等多学科交叉为特点，主要包括医学图像和医学工程所涉及的基础研究。
影像医学领域主要资助以医学影像和医学信息为主要研究内容的基础研究，包括磁共振成像（MRI），X射线成像与计算机断层成像（CT），超声医学，核医学，医学光子学与光学成像，分子影像与探针，脑电图、脑磁图与脑机交互，医学图像处理与分析，医学信息系统与远程医疗，影像引导下治疗与导航技术，以及介入医学等相关科学问题的研究。其中，应用MRI、FMRI、MRS、CT、超声、核医学、光学成像等手段，结合医学图像处理与分析，更好地解决影像医学基础科学问题是本领域研究的重要支持方向。同时鼓励在分子探针与分子影像，脑电图、脑磁图与脑机交互等前沿科学领域进行多学科交叉的探索性研究；鼓励影像引导下治疗与导航技术以及介入医学等方面的基础研究。
生物医学工程领域主要资助与疾病诊疗相关的医学工程以及与再生医学相关的基础研究，包括医学信号检测、识别、处理与分析，生物医学系统建模与仿真，生物医学传感，机器人辅助，康复工程，纳米医学，药物与基因载体系统，医用生物材料与植入科学，细胞移植、组织工程与再生医学，人工器官与特殊感受器仿生，电磁与物理治疗以及用于检测分析、成像与治疗的医学器件和仪器等方向的相关科学问题的研究。其中，医学信号检测、传感与建模，细胞移植，植入医学与再生医学等为本领域资助的重点研究方向。
多学科交叉促进了影像医学与生物医学工程学的快速发展。本科学处将继续关注影像医学/生物医学工程学与数学、物理、化学等基础科学，与信息科学、材料与工程等应用科学的交叉性研究；同时对上述交叉研究前沿领域中的青年学者予以适当倾斜支持；鼓励不同学术背景的科学家合作，鼓励开展多学科交叉性的研究工作。
本科学处不受理神经系统肿瘤相关的项目申请，相关项目请在医学科学五处（H16）申请。此外，不受理放射治疗与放射防护的申请，相关项目请选择医学科学五处（H16）的肿瘤物理治疗申请代码，以及医学科学六处（H22）放射医学申请代码；不受理药物与给药方式的申请，相关项目请选择医学科学七处（H30、H31）药物学或药理学申请代码。
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