国别（地区）合作与交流
亚洲、非洲地区、国际组织
截至2010年，国家自然科学基金委员会与亚洲、非洲国家的科学基金组织或研究理事会签订了12个双边科技合作协议或谅解备忘录，与7个国际组织签署了科技合作协议。2010年新签署了与南非国家研究基金会和联合国环境规划署的谅解备忘录。
1．中日韩前瞻计划
国家自然科学基金委员会（NSFC）与日本学术振兴会（JSPS）和韩国国家研究基金会（NRF）共同设立的A3前瞻计划（Asia 3 Foresight Program），联合资助中国、日本、韩国三国科学家在选定的战略领域共同开展世界一流水平的合作研究，以达到培养青年杰出人才和共同解决区域问题的目的。中日韩前瞻计划每年的合作领域将与前一年NSFC、JSPS、NRF共同举办的东北亚会议主题一致。2010年的东北亚会议主题为“信息通讯技术：下一代互联网和网络安全（ICT：Next Generation Network and Network Security）”。2011年东北亚会议的主题为等离子体物理。
中国、日本、韩国三方于12月在网上同时发布项目指南，受理申请，每年资助两项，每个项目的中方资助经费见项目指南，资助期限为3年。根据国家自然科学基金委员会与JSPS和NRF达成的协议，中国、日本、韩国三方对进展优秀和确需延续执行的项目增加为期两年的资助，资助金额见项目指南。
国际合作局将会同相关科学部在项目执行两年后组织专家组对项目进行中期检查和项目延续的评审，再根据与JSPS和NRF商定的结果，确定是否给予延续资助。
2．与JST的合作研究项目
自2004年开始，国家自然科学基金委员会与日本科学技术振兴机构（JST）启动了“建设环境友好和环境低负荷型社会的科学技术研究”的合作研究计划。每年双方协商确定具体的合作领域，并围绕当年确定的合作领域轮流在中国和日本共同举办一次双边研讨会。研讨会上，双方专家根据合作领域提出具体的研究方向。
2010年的合作领域是：废弃物和废热的能源循环技术(Energy Recycling Technology for Waste and Exhaust Heat）。
2011年的合作领域将由中日双方于2011年上半年协商确定。
双方于每年9月在网上公布当年具体合作领域并受理项目申请，资助项目不超过5项。经双方协商，自2009年起，每个项目中方经费从100万元增加为150万元；日方项目经费也得到相应增加。资助期限为3年，资助经费见项目征集指南。
国际合作局将会同相关科学部在项目执行两年后组织专家组对项目进行中期检查。经NSFC和JST双方商定，在项目资助期满后，召开联合结题评估会议，对NSFC-JST合作研究项目进行联合结题评估。结题评估优秀且有必要继续合作的项目可申请增加3年的资助，每年延续资助最多两项，资助经费见项目指南。
3．与JSPS的双边合作
根据国家自然科学基金委员会与日本学术振兴会（JSPS）签署的学术交流备忘录，双方每年共同资助10项合作交流项目，资助期限为3年，每个项目每年各方交流量不超过60人天；共同资助4项由中日科学家共同组织召开的双边学术研讨会，其中2项在中国召开，2项在日本召开，双边学术研讨会要求每方参会人员至少来自3个单位。
双方于每年6月在网上发布项目指南，申请截止日期为9月份第一个完整周的星期五。
4．与NRF的双边合作
根据双方协议，国家自然科学基金委员会与韩国国家研究基金会（NRF）每年共同资助包括合作交流和双边学术研讨会等在内的双边合作与交流项目，合作交流项目资助期限为2年，双边学术研讨会要求每方参会人员至少来自3个单位。
双方于每年10月在网上发布项目指南，合作交流项目和双边学术研讨会的申请截止日期分别为12月15日和下一年度的1月15日。每年的双边合作与交流项目由中韩基础科学联合委员会通过会议的形式讨论确定。2010年中韩基础科学联合委员会共批准了30项双边合作与交流项目，包括19项合作交流项目，11项双边学术研讨会。2011年双方共同资助的项目数量在30项左右。
5．与CSIR的双边合作
根据双方协议，国家自然科学基金委员会与印度科学与工业研究理事会（CSIR）共同资助包括合作交流和双边学术研讨会等在内的双边合作与交流项目，合作交流项目资助期限为3年。2011年双方继续支持双边学术研讨会，数量在4项以内；同时共同支持有机化学和化学生物学、纳米科学、气候变化、天文等领域的合作交流项目，数量在5项以内。
6．与ISF的双边合作
根据双方协议，国家自然科学基金委员会与以色列科学基金会（ISF）联合资助重点为纳米科学、信息学、化学科学、农业和水利等自然科学领域内的合作研究和双边研讨会。研讨会主题由双方机构协商确定。2010年两个研讨会的主题分别为：药物设计的理论和实验、量子体系的动力学和调控。双方已商定于每年11月份发布项目指南。
7．其他
国家自然科学基金委员会与埃及科技研究院、巴基斯坦科学基金会、泰国国家研究理事会、泰国研究基金会、印度科学技术部等政府部门和资助机构签署双边合作协议，联合资助双方科学家的合作交流项目及共同组织的双边学术研讨会，具体项目根据科学家的申请由双方协商确定。
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