当代数学的发展越来越展示出各分支学科的内在统一性，也表现出越来越多的应用性。数学科学处鼓励针对当前数学发展的特点和数学中的重要问题、公开问题开展原创性研究，以及开展新的数学方法、数学模型的建立等方面的研究；鼓励数学不同分支学科之间的相互渗透。要求申请者及其研究团队应具备相当的研究基础和研究能力，并对所研究课题的现状、拟解决的主要问题、已有的研究方法和手段等有深入的了解，在此基础上制定自己的研究计划。通过对项目的资助和实施,培养优秀人才,调整与重组研究方向,逐步使我国的数学研究方向与国际数学研究的主流接轨,为赶超国际数学研究水平打下良好的研究基础。

　　资助的主要范围:数理逻辑与数学基础，数论，代数学，几何学，拓扑学，函数论，泛函分析，常微分方程与动力系统，偏微分方程，概率论数理统计，控制论，离散数学，计算数学，大规模科学与工程计算，数学物理，运筹学的数学理论和方法，数学的其他边缘性学科，实际问题中的数学模型和新算法。

　　自由申请项目侧重支持整体研究实力强的课题组和具有实际应用背景的项目；青年基金项目是帮助申请者独立从事他们感兴趣的数学研究，通过项目的实施，培养优秀的数学人才；地区基金项目旨在营造数学研究环境，保持数学力量相对薄弱单位的研究队伍，逐步提高他们的研究水平，为当地科技发展发现、培养优秀数学人才。对于个人单独申请或同单位同方向的分头申请，以及有在研项目的申请从严掌握，以保持适当的资助规模。

　　对于基础数学项目的资助，旨在保持我国具有优势的研究方向和具有一定规模的研究领域；促进我国基础相对薄弱，但作为国际主流研究方向的发展领域；鼓励各分支学科的相互交叉与渗透。对于应用数学和计算数学项目的资助，鼓励有较强背景和应用前景的课题；关注生命科学、信息科学、材料科学、环境科学、能源科学以及与经济发展和社会进步有密切关系的科学领域的发展，主动了解这些科学领域中一些重要的前沿科学问题，积极寻找与这些领域交叉和渗透的切入点，以促进应用数学的发展。
数学天元基金侧重资助数学人才培养和学术交流活动，详见《指南》专项基金项目章节的内容。