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重点项目是国家自然科学基金研究项目系列中的另一个重要类型，其定位是在促进学科均衡协调和可持续发展的基础上，根据国家自然科学基金优先发展领域，通过指南引导，更集中地瞄准国际前沿，整合创新资源，孕育重点突破。重点项目主要支持科技工作者结合国家需求，针对我国已有较好基础和积累的重要研究领域、对学科发展具有重要推动作用的领域或新学科生长点开展深入、系统的创新性研究工作。
为实现重点突破的目标，重点项目进一步强调有限目标、有限规模和重点突出的原则，重视学科交叉与渗透，强调利用现有重点科学基地的条件。重点项目基本上按照五年规划进行整体布局，每年确定受理申请的研究领域、发布指南引导申请。研究期限一般为4年。申请重点项目的基本要求，请参照前面的申请须知和限项规定相关部分，撰写重点项目申请书要按照重点项目撰写提纲撰写。
2007年度国家自然科学基金重点项目申请1
754项，批准资助373项，资助经费63
530万元，平均资助强度170.32万元/项。2008年度重点项目将按照“十一五”规划的部署，继续扩大资助规模，提高资助强度，拟资助重点项目426项左右，资助总经费约79
200万元，平均资助强度约185万元/项。
2007年度重点项目资助情况
金额单位：万元
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科学部 |
申请项数 |
批准资助 |
资助率
（%） |
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项数 |
金额 |
资助金额占全委比例（%） |
单项平均
资助金额 |
|
合计 |
1754 |
373 |
63 530 |
100 |
170.32 |
21.27 |
|
数理科学部 |
152 |
45 |
8 600 |
13.54 |
191.11 |
29.61 |
|
化学科学部 |
117 |
42 |
7 210 |
11.35 |
171.67 |
35.90 |
|
生命科学部 |
675 |
113 |
17 850 |
28.10 |
157.96 |
16.74 |
|
地球科学部 |
322 |
56 |
9 500 |
14.95 |
169.64 |
17.39 |
|
工程与材料
科学部 |
246 |
61 |
10 920 |
17.19 |
179.02 |
24.80 |
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信息科学部 |
168 |
42 |
8 050 |
12.67 |
191.67 |
25 |
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管理科学部 |
74 |
14 |
1 400 |
2.20 |
100 |
18.92 |
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