信息科学三处资助自动化科学与技术及相关交叉学科领域的基础理论和关键技术研究，主要资助领域包括：控制理论及应用；导航、制导与传感器技术；系统科学与系统工程；模式识别及应用；人工智能与知识工程；机器人学；认知科学及智能信息处理等七大领域。近几年来，纳米科学、生命科学、认知科学和复杂性科学等得到了迅速的发展。其中，微纳操作与量子系统控制、生物信息学与系统生物学、认知过程及智能信息处理、复杂系统建模、分析与控制、网络系统建模与控制等不仅为自动化科学与技术提出了新的机遇和挑战，而且正逐步成为自动化科学与技术新的研究领域。国内生产领域中高消耗、高排放、高污染和低效益的现状以及社会发展对绿色经济和循环经济的需求，迫切需要自动化科学与技术方面的专家从中提炼科学问题，进行创新性研究和关键技术的突破。今后一段时期内，信息科学三处将继续支持传统领域中创新性强的基础研究和关键技术研究,鼓励支持从社会经济、人类健康和国家安全中提炼基础科学问题的研究，并鼓励支持跨学科领域的研究。

　　2006年信息科学三处共受理面上项目申请1244项（自由申请897项、青年基金329项、地区基金18项），共资助三年期项目207项（自由申请150项、青年54项、地区3项），资助小额探索项目24项（自由申请12项、青年基金11项、地区基金1项）。自由申请、青年和地区基金项目的平均资助强度分别为25.5万元/项、24万元/项和24万元/项，小额探索项目的平均资助强度为8万元/项。含小额探索项目的平均资助率为18.57%。

　　从2006年起，信息科学三处开始受理“铁道联合资助项目”的申请。2006年，共受理该联合资助项目的面上申请82项，资助13项，资助率为15.85%，平均资助强度为24.62万元。请相关申请者注意这方面信息，并按2007年《指南》中的有关规定填写申请书和进行申报。

　　信息科学三处2007年鼓励支持的研究领域主要包括：面向节能、降耗与降低污染的生产过程一体化控制与调度；网络化系统及网络信息的处理与控制；复杂系统的建模、分析与优化控制；生物与生命科学中的信息处理与控制问题；新的信息获取方法与新型传感技术；多源信息融合；模式识别的新理论与新方法；人工智能的新理论与新方法；先进机器人系统及其关键技术；认知过程及智能信息处理。