2020年6月11日，第八届国家自然科学基金委员会（以下简称自然科学基金委）第三次全体委员会议在北京召开。会议全面贯彻党的十九大和十九届二中、三中、四中全会精神，认真落实习近平总书记关于基础研究的系统性论述和党中央、国务院关于加强基础研究的决策部署，扎实推进中央巡视整改任务，总结过去一年和今年以来的工作，审议科学基金系统性改革方案，确定今年重点工作任务，促进基础研究高质量发展。
自然科学基金委党组书记、主任李静海作题为《深化科学基金改革 推动基础研究高质量发展》的工作报告。他指出，在党中央、国务院坚强领导和科技部统筹管理下，自然科学基金委2019年各项工作取得新进展。坚持党建引领，系统推进深化改革；持续推进全面从严治党，加强作风学风建设；坚持需求导向和原创导向，加快部署关键重点领域；落实中央人才工作部署，加大优秀人才培养力度；深化联合基金管理改革，建立多元投入机制；拓展国际（地区）合作网络；推进中长期发展规划战略研究，主动对接国家科技规划；积极进行改革试点，优化项目和资金管理，在“杰青”中试点项目经费使用“包干制”,开展“优青”“创新研究群体”“海外港澳学者”三类人才项目提高间接费用占比试点，调整限项要求，优化项目申请。
李静海强调，新冠肺炎疫情发生以来，自然科学基金委深入贯彻习近平总书记关于新冠肺炎疫情防控的重要指示精神，根据立足解决科学问题、兼顾应急与长远、避免重复资助的原则，先后以专项项目、重大项目等形式组织科研人员聚焦疫情防控中的关键科学问题开展研究。调整2020年项目申请与结题时间安排，实施项目申请和结题材料在提交阶段的无纸化，支持广大科研人员更好投入疫情防控工作。与英国国家科研创新署、德国研究联合会等发表联合声明，与德国研究联合会、韩国国家研究基金会、瑞典研究理事会、金砖五国等以双多边方式联合资助新型冠状病毒相关研究。
李静海指出，自然科学基金委认真落实习近平总书记关于基础研究的重要论述和党中央、国务院关于加强基础研究的决策部署，推进深化改革，确立了系统性改革方案。改革的目标是构建理念先进、制度规范、公正高效的新时代科学基金治理体系。改革的核心任务是明确资助导向、完善评审机制、优化学科布局，改革的重要举措包括加强三个建设（党建和党风廉政建设、学风和科研诚信与伦理建设、组织机构和队伍建设），完善六个机制（面向国家重大需求的科学问题凝练机制、面向世界科学前沿的科学问题凝练机制、重大类型项目立项机制、促进成果应用贯通机制、学科交叉融合机制、多元投入机制），强化两个重点（原创探索计划、人才资助体系升级计划），优化七方面资助管理（明确各层次优先领域、系统深化国际合作、持续完善规章制度、持续改进项目管理、持续规范资金管理、持续开展绩效评价、加强依托单位管理）。
李静海强调，2020年是全面进入创新型国家行列之年，是“十三五”收官之年和中长期及“十四五”谋篇布局之年。自然科学基金委要以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，深入贯彻党的十九大和十九届二中、三中、四中全会精神，认真落实习近平总书记关于科技创新的重要论述精神，坚持稳中求进总基调，抢抓科研范式转变机遇，持续推进深化改革重点任务落实，加快构建新时代科学基金治理体系，推进治理能力现代化，更好发挥科学基金在国家创新体系中的独特作用，为建设世界科技强国作出新贡献。
第五届监督委员会主任陈宜瑜作监委会工作报告。他指出，2019年，监委会大力巩固科研诚信教育成果，激励践行新时代优良作风学风，推动科研诚信与伦理制度建设。夯实全过程全覆盖监督机制，在项目申请阶段开展高相似度检查，在不同时段与有关主体签署公正性承诺书，在项目会议评审期间开展驻会监督。依规依纪严肃查处科研失信行为，顺利完成了全年工作任务。2020年，监委会将按照党中央、国务院对于科研诚信、科研伦理和学风建设的新要求，进一步加强党对监督工作的领导，认真落实巡视审计整改任务要求，加强对科研失信行为的联合惩戒，进一步压实主体责任，发挥好依托单位在科学基金工作中的支撑、协调、管理、服务作用，完善顶层设计，加快构建“教育、激励、规范、监督、惩戒”一体化的科学基金科研诚信建设体系，为科学基金深化改革、基础研究高质量发展提供坚强保障和支撑。
党组成员、副主任王承文通报中央第二巡视组关于巡视国家自然科学基金委员会党组的反馈意见及整改落实情况。
会议审议通过了李静海作的题为《深化科学基金改革 推动基础研究高质量发展》工作报告、陈宜瑜作的题为《弘扬科学家精神加强作风学风建设 提升诚信治理能力 全力推进新时期科学基金科研诚信体系建设》的监委会工作报告；审议通过了《国家自然科学基金深化改革方案》。会议还审议了《2019年科学基金预算与资助计划执行情况及2020年预算与资助计划的报告》。
2019年度，自然科学基金委共接收2378个依托单位提交的各类项目申请250703项，比上年的225352项增加25351项，增幅11.25%。严格遵循科学基金评审原则和程序，加强资助工作各环节的组织协调，择优资助了1469个依托单位的各类项目45192项，资助直接费用（含联合资助方经费）280.81亿元，资助间接费用49.36亿元（涉及1454个依托单位），圆满完成2019年度资助计划任务。2020年科学基金拟安排资助计划约295亿元（含联合资助方经费），预计间接费用约56亿元，合计总资助经费约351亿元。截至5月20日，已收到26.97万项申请，比2019年同期增加12.03%。目前正在紧张有序开展评审。
自然科学基金委党组成员、副主任高福主持开幕式。第八届国家自然科学基金委员会委员，中央纪委国家监委驻科技部纪检监察组副组长玄洪云、中央组织部有关同志出席会议，自然科学基金委顾问，第五届监督委员会委员，科学部主任（兼职），各部门负责同志全程列席会议。全委近600余名干部职工以视频方式参加开幕式。