自然科学基金主要起到“育种”的作用
2007年国家自然科学奖一等奖获得者、中国科学院院士、全国政协委员闵乃本.:
我必须要感谢国家自然科学基金对我的支持。1984年，国家开始设立自然科学基金支持基础研究，这让我感到自己的科学设想有可能实现，在1984年到1991年这段时间，我的研究经费主要是来自国家自然科学基金的支持。现在，我的研究团队里还有很多项目仍然在得到自然科学基金的支持。
自然科学基金主要起到“育种”的作用。正是由于国家自然科学基金的支持，我的课题组开始取得一些成绩，逐渐得到了科学界的承认，科学研究逐步开始过渡到国家攀登计划、973计划上面，这些项目让我有了科研经费的保证。通过国家重点实验室的建立，实验室相继购置了激光器、电子显微镜、聚焦离子束等现代化仪器和设备，科研条件得到大幅改善。这更让我对该研究方向的选择充满了信心。
设立“杰青”基金是一种创新
全国政协委员、中国气象局副局长宇如聪:
作为国家杰出青年科学基金的获得者，很荣幸，最早获得的“杰青”基金有100万元左右，现在有200万，支持力度仍在不断增加。我认为，10多年前自然科学基金委设立的国家杰出青年科学基金，本身就是一种创新。是尊重知识、尊重人才的体现。不仅稳定了大批青年科学工作者在国内开展研究工作，还吸引了一批海外人才回国施展宏图，对于稳定一支高水平的基础研究队伍，培养和造就活跃在世界科学前沿和关键领域的优秀学术带头人，孕育创新研究群体和团队等方面，发挥了重要作用，取得了显著的成绩，得到科技界和社会各界的广泛关注和好评。目前，国家杰出青年科学基金获得者已经和正在成为我国基础研究创新的中坚力量。
加大对非共识项目的扶持力度
全国政协委员、北京理工大学教授王涌天:
我和自然科学基金结缘已久，自上世纪90年代以来，我一共申请了七八个面上项目基金，同时还获得了国家杰出青年科学基金。自然科学基金的评审过程比较公正，并且资金的拨付一直都很及时，明年的项目一般都在今年的10月底支付完毕。
近年来，国家对自然科学基金的投入不断加大，从80年代的3000万元到如今的53亿元，10多年前，我申请的一个面上基金大概是2.5万元，如今，提高了很多，一个面上基金大概有30万元。这对基础科研起到至关重要的推动作用。但我认为这钱还是不够，国家每年有1000亿元用于科学研究，而对自然科学的投入只占1/20，显然太少，国家还应不断加强在自然科学基金的投入。
同时，我认为，自然科学基金应该在大力发展非共识项目方面加大扶持力度，虽然风险很大，但在大力创建创新型国家的今天，无疑是一种很好的方式，自主创新的关键之一就是鼓励创新思维，对于这些新奇的想法，我们也要有博大的胸怀，并允许失败。
面上项目对基础研究起到了重要的支撑作用
全国政协委员、中国科学院古脊椎动物与古人类研究所原所长邱铸鼎:
我申请面上的基金有2～3个，最少的也有十几万。我认为，国家应大力加强对面上项目的扶持力度，在每年自然科学基金的申请项目中，面上项目占了很大一部分，并且这些面上项目，涉及领域方方面面，对我国的基础科学研究起到很重要的支撑作用。事实证明，自然科学基金是相对公正的评审方式。同时，我建议适当调整基金的比例，把一部分经费放在各科研单位，因为自然学科的复杂性，基金委的专家评审人员也很难涉及这么多的领域，在评审过程中难免会出现偏差。放在各科研单位的经费也要建立相应的机制，有高层次的监督机构，维护科学的公证性。
自然科学基金是支持基础研究的最好形式
全国政协委员、第三军医大学军队劳动卫生学教研室主任余争平:
1996年我博士刚毕业，就得到过自然科学基金项目支持，当时真有雪中送炭的感觉。在我国的科研经费分配体制中，“973”、“863”等各种资助方式都行之有效，但它们有不同的侧重，要解决的问题不同。我个人认为，支持基础研究的最好方式是国家自然科学基金。基础研究有其自身的规律性，我们不可能要求每一个项目都成功，如果对一个探索性的基础研究投入过多，可能会浪费我们一些珍贵的科研资源。而国家自然科学基金中支持数量最多的面上项目和大部分重点项目就很好地解决了这一层面的问题。