2004年12月7日中国科学技术信息研究所在北京国际会议中心召开了“2003年度中国科技论文统计结果”新闻发布会，国家自然科学基金委员会和中国科学院共同主办的《自然科学进展》被评为“第三届中国百种杰出学术期刊”，这是《自然科学进展》期刊连续第二次荣获该项荣誉。