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2009年，科学基金国际合作资助工作将切实贯彻科学发展观，准确把握科学基金战略定位，贯彻落实《国家自然科学基金条例》，围绕科学基金的中心任务，继续鼓励科学基金项目承担者开展富有成效的国际合作与交流活动，充分利用国际科技资源，着力提升我国基础研究的创新能力。根据国家自然科学基金“十一五”规划的部署，科学基金国际合作将坚持以交流型合作为基础，以实质性合作研究为重点，以充分吸纳和利用海外资源，提升自主创新能力为目标，扎实推进战略型合作。2009年，科学基金国际合作资助工作将稳步推进与美国在更多领域的实质性合作，深化与德国、英国、法国以及欧盟的合作，巩固与俄罗斯的合作，继续强化与日本、韩国以及国际科学研究组织的合作，开拓与发展中国家的合作。
为此，2009年度科学基金国际合作资助将着重做好以下几个方面的工作：
（1）继续加强和完善实质性合作研究项目的组织和实施，引导科研人员充分吸纳和利用全球科技资源；
（2）充分发挥双（多）边协议渠道的重要作用，继续加强与境外基金组织的战略型合作，在更高层次上筹划和组织实质性、高水平的合作研究项目；
（3）实施卓越管理，进一步完善管理办法，规范审批流程，严格执行预算制，提高管理和资助效益，为广大科技人员营造开展国际（地区）合作与交流的良好环境；
（4）继续做好国际（地区）合作研究、重大国际（地区）合作研究和国际学术会议（包括协议内）项目的资助工作。
关于各类国际（地区）合作与交流项目的具体申请要求及相关项目的管理办法、国际合作局的主要职责、组织机构分工、协议概况、协议名录等，请查阅自然科学基金委网站。
2009年，重大国际（地区）合作研究项目的受理仍在科学基金项目统一受理期间进行。除特殊说明之外，其他类型的非集中受理的国际（地区）合作与交流项目请避开集中接受期间申请。自然科学基金委与国外科学基金组织和科研机构共同设立合作研究项目的申请指南将在自然科学基金委网站上随时发布，公开征集项目。
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