专项项目是自然科学基金委为专门支持或加强某一领域或某一方面而设立的专款资助项目，目前包括数学天元基金、科学仪器基础研究专款和重点学术期刊专项基金三类，其中的数学天元基金项目和重点学术期刊专项基金不参加各类项目的限项检索，科学仪器基础研究专款项目计入重点项目的限项检索范围。原复杂性科学研究专款项目已经归并到管理科学部的面上项目中正常受理，可参见《指南》中面上项目管理科学部一处介绍，希望引起申请者的特别注意。
