信息科学三处资助自动化科学与技术及相关交叉学科领域的基础理论和关键技术研究，主要资助范围包括：控制理论及应用；导航、制导与先进传感器；系统科学与系统工程；模式识别及应用；人工智能与知识科学；机器人学；认知科学及智能信息处理七大领域。近几年来，纳米科学、生命科学、认知科学和复杂性科学等在世界范围内得到了迅速的发展。其中，微-纳操作与量子系统控制、生物信息学与系统生物学、认知过程及智能信息处理、复杂系统建模、分析与控制等不仅为自动化科学与技术提出了新的机遇和挑战，而且正在成为自动化科学与技术新的研究领域。国内生产领域中高消耗、高排放、高污染和低效益的现状以及社会发展对绿色经济和循环经济的需求，迫切需要自动化科学与技术方面的专家从中提炼科学问题，进行创新性研究和关键技术的突破。今后一段时期内，信息科学三处将继续支持传统领域中创新性强的基础研究和关键技术研究，鼓励支持从社会经济发展和国防安全中提炼出来的基础科学问题的研究，并鼓励支持交叉学科领域方面的研究。

　　2005年，信息科学三处（原自动化学科）共受理面上项目1007项（其中：自由申请763项，青年基金233项，地区基金11项），共批准资助三年期项目190项（含7项与数学交叉项目和4项健康类项目），平均资助强度23.23万元/项；另外，还批准资助了26项小额探索项目（含1项与数学交叉项目），平均资助强度为6.04万元/项。面上项目平均资助率（含小额探索项目）为21.45%。与2004年相比，2005年面上项目的资助率和资助强度均有所提高。2005年，信息科学三处受理的面上项目中有35项因违反各种申请规定被初筛去掉，初筛减率为3.5%，较2004年（4.8%）有所下降。希望申请者在2006年申报项目时认真阅读《指南》、仔细校阅申请书并严格核实课题组每个成员的在研、参加和当年申报的基金项目数，以免类似情况发生。

　　信息科学三处2006年支持的鼓励研究领域主要包括：面向节能、降耗与降低污染的生产过程一体化控制与管理；网络化系统及网络系统控制；复杂系统的建模、分析与安全控制；系统生物学中的控制问题；新型传感器与多源信息融合；模式识别的新理论与新方法；人工智能的新理论与新方法；先进机器人系统及其关键技术；认知过程及智能信息处理。